Với mục tiêu tập trung các trang thiết bị hiện đại, đồng bộ, tiến hành các nghiên cứu cơ bản và nghiên cứu ứng dụng, triển khai các kết quả nghiên cứu vào việc bảo đảm an toàn thông tin trong các lĩnh vực kinh tế, văn hóa, xã hội, quốc phòng, an ninh, 10 năm qua, PTNTĐ An toàn thông tin đã trở thành một cơ sở nghiên cứu KH&CN quan trọng hàng đầu của đất nước về an toàn thông tin.
Hàng năm, Phòng thí nghiệm đã nghiên cứu thành công nhiều giải pháp, sản phẩm có hàm lượng KH&CN cao, hợp tác với nhiều đơn vị trong và ngoài quân đội nghiên cứu, triển khai các kết quả trong thực tiễn.
Một số sản phẩm nổi bật của Phòng thí nghiệm có thể kể đến là: Phần mềm bộ gõ tiếng Việt VIETKEY; phần mềm chống truy cập trái phép cho máy tính cá nhân; các phần mềm diệt virus; hệ thống quản lý công văn, điều hành tác nghiệp; module phần mềm quản lý, giám sát tàu thuyền…
Trước đây, PTNTĐ An toàn thông tin trực thuộc Viện KH&CN Quân sự - Bộ Quốc phòng, từ tháng 2.2012, Phòng được bàn giao về Cục Công nghệ thông tin - Bộ Tổng tham mưu - Bộ Quốc phòng.
