Các Doanh nghiệp bị “đưa vào tầm ngắm” là DN hoạt động dưới 12 tháng không đóng góp vốn điều lệ theo quy định, đăng ký kinh doanh nhiều ngành nghề, đăng ký kinh doanh tại địa phương khác nơi đăng ký hộ khẩu thường trú. DN có doanh thu lớn nhưng kho hàng không tương xứng hoặc không có kho hàng hóa, không có xưởng sản xuất hoặc lực lượng lao động không tương xứng (dưới 10 lao động).
Các DN xin ngừng nghỉ, bỏ kinh doanh, tạm ngừng, có công văn giải thể sau đó xin hoạt động trở lại, thay đổi người đại diện trước pháp luật, thay đổi trụ sở kinh doanh dẫn đến thay đổi cơ quan quản lý thuế cũng là đối tượng được tăng cường kiểm tra, rà soát thuế.
Ngoài ra, các DN mua bán, sáp nhập với giá trị dưới 100 triệu đồng; DN nhỏ hoặc có doanh thu đột biến tăng từ 50% trở lên nhưng số thuế GTGT phát sinh phải nộp thấp, không có thông báo phát hành hóa đơn hoặc có thông báo phát hành nhưng không có báo cáo tình hình sử dụng hóa đơn (hoặc chậm báo cáo)... cũng là dấu hiệu cơ bản để các cơ quan thuế ở địa phương phát hiện xử lý vi phạm về mua bán, in, phát hành quản lý và sử dụng hóa đơn hàng hóa, dịch vụ.