Ngoài ra, còn có các trường hợp bị chấm dứt đăng ký websites khác gồm tổ chức thiết lập websites ngừng hoạt động hoặc chuyển nhượng cho tổ chức khác; thực hiện các hành vi bị cấm trong hoạt động TMĐT theo quy định tại Điều 4 Nghị định số 52/2013/NĐ-CP; không thực hiện nghĩa vụ báo cáo theo quy định tại Nghị định số 52/2013/NĐ-CP và tiếp tục tái phạm sau khi đã được nhắc nhở; bị hủy bỏ đăng ký theo quyết định xử lý vi phạm của cơ quan nhà nước có thẩm quyền.
Bộ Công Thương sẽ công bố trên Cổng thông tin Quản lý hoạt động TMĐT danh sách các website TMĐT vi phạm pháp luật theo quy định tại Điều 4 Nghị định số 52/2013/NĐ-CP và các quy định về xử lý vi phạm hành chính trong TMĐT. Thông tin về các website cung cấp dịch vụ TMĐT bị hủy bỏ đăng ký cũng sẽ được công bố trên Cổng thông tin Quản lý hoạt động TMĐT.
Thông tư này có hiệu lực thi hành kể từ ngày 01-07-2013 và thay thế Thông tư 46/2010/TT-BTC.