Căn cứ vào kết quả thanh tra, tùy theo mức độ, đoàn tranh tra liên ngành sẽ đưa ra biện pháp xử lý tại chỗ hoặc đề xuất phương án xử lý với cơ quan có thẩm quyền về các hành vi vi phạm của các đơn vị, doanh nghiệp.
Theo BHXH TP Hà Nội, hiện nay chưa có quy định về việc giảm lãi, khoanh nợ đối với các đơn vị chậm đóng BHXH. Không những thế, các đơn vị chậm nộp BHXH còn phải chịu xử phạt vi phạm hành chính. Đồng thời, tại điều 214, 216 Bộ Luật Hình sự số 100/2015/QH13 quy định về việc phạt tiền, phạt tù đối với tội "Gian lận BHXH, bảo hiểm thất nghiệp" và tội "Trốn đóng BHXH, BHYT cho người lao động".
