Trong đơn kiện, Hữu Luân đề nghị Tòa hành chính - TAND TPHCM xem xét thụ lý, giải quyết vụ án hành chính và ban hành các quyết định: Yêu cầu Bộ GD-ĐT hủy bỏ các quyết định 1305, 1306 và quyết định 3080 của Bộ GD-ĐT do nhận định, đề xuất và đưa ra lý do cho rằng ông “thiếu trung thực” để thu hồi bằng thạc sĩ, hủy bỏ kết quả thi nghiên cứu sinh là không đúng sự thật, không có căn cứ về mặt pháp lý; yêu cầu Bộ GD-ĐT công khai xin lỗi ông trên 3 số báo liên tiếp của các cơ quan báo chí Trung ương và địa phương; yêu cầu Bộ GD-ĐT bồi thường thiệt hại về danh dự, nhân phẩm, uy tín của ông, đã bị xâm phạm bởi những quyết định trên, theo quy định của pháp luật.